Paní Brisbyová je vdova a kromě toho také hospodyňka v domacnosti se čtyřmi dětmi.Když její nejmladší syn Timmy onemocní zápalem plic,vydáva se za starým panem Fitzibonsem pro radu.Ten jí řekne,aby se vidala pro lék do výzkumného centra N.I.M.H...A tak se paní Brisbyová vidáva na dobrodružnou cestu na které jí potkává mnoho nástrach a nebezpečí.Ale také nečekaná prátelství.

 Malebné trnové údolí je příhodným místem pro život jednoho myšího národu,jemuž tu nechybí ke štěští vůbec nic.No nic,o no se nakonec vždycky něco najde-co takhle mít svého hrdinu.Proto myšky vyzvou Timmy Brisbyho,nejmladšího synů Jonathana Brisbyho (Ten je kdysi zachránil před zlověstným místem zvaným NIMH.)Jetu ale problem-Timmy v hrdinských činech.Ještě zdaleka  neumí chodit  a tak musí podstoupit treninkový program hrdinů 101.Zvládne hadí hlítku a další úkol,než však může být  jménovan absulventem pogramu musí svůj um prokázat v praxi.Madá myška Jenny potřebuje,aby někdo zachránil její rodiče z NIMH a varuje ostatní,že je bezpečí trnového údolí ohroženo.A tak je úkol pro Timmyho.Tajemství N.I.M.H.